Logiciels de modélisation moléculaire
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Accelrys
Les logiciels Accelrys fonctionnent avec des licences à jetons. Le CRIHAN possède 35 jetons qui sont distribués suivant les besoins par le serveur de licences. Toute machine du Réseau Normand de Modélisation Moléculaire peut accéder aux logiciels pour peu qu'elle soit connectée à Internet.
Les logiciels Accelrys
La documentation est accessible via le site Internet Accelrys et une liste des modules est disponible en ligne.
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InsightII, "a sophisticated molecular modeling environment".
Disponible sous SGI et Linux. Certains modules sont aussi utilisables sur le supercalculateur IBM.
(http://www.accelrys.com/insight/index.html) -
Cerius2, "the leading modeling and simulation environment".
Disponible sous SGI et Linux.
(http://www.accelrys.com/cerius2/index.html) -
Catalyst, "modeling, hypothesis generation and structure search for drug discovery".
Disponible sous SGI, Linux et IBM (supercalculateur du CRIHAN).
(http://www.accelrys.com/catalyst/index.html) -
Felix, "the industry standard for off-line data processing, spectral visualization and analysis software for all types of high resolution, one- dimensional to four dimensional, homonuclear and heteronuclear NMR data".
Disponible sous SGI, Linux, Windows 98, 2000, XP et NT.
(http://www.accelrys.com/felix/index.html) - CNX, "tools for X-ray and NMR structure determination".
Disponible sous SGI, Linux et IBM (supercalculateur du CRIHAN).
(http://www.accelrys.com/products/cnx/index.html) - Material Studio, "a comprehensive family of modeling and
informatics software for materials research".
Disponible sous Windows 2000, XP et NT.
(http://www.accelrys.com/mstudio) - Discovery Studio, "a comprehensive family of modeling and
information solutions for life sciences".
Disponible sous Windows 2000, XP et NT.
(http://www.accelrys.com/dstudio)
Tripos
Les logiciels Tripos ont le même mode de fonctionnement que les logiciels Accelrys, avec un système de 10 jetons.
Les logiciels Tripos
La documentation est intégrée au logiciel Sybyl et une liste des modules est disponible en ligne.
- Sybyl, "expert molecular modeling environment".
Disponible sous SGI et Linux.
(http://www.tripos.com/sciTech/inSilicoDisc/emmt.html) - Unity, intégré maintenant dans l'interface de Sybyl
Disponible sous SGI et Linux.
Gaussian
Gaussian fonctionne de manière autonome, sans demander de licence à un serveur.
Distribution acquise en version source pour toutes les stations Unix du projet. Gaussian est également disponible sur le supercalculateur IBM.Schrödinger
Les logiciels Schrödinger ont le même mode de fonctionnement que les logiciels Accelrys et Tripos, avec un système de jetons.
Les logiciels Schrödinger
La documentation est installée avec le logiciel Jaguar.
- Jaguar, "extremely fast ab initio electronic structure package".
Disponible sous SGI, Linux et IBM (supercalculateur du CRIHAN).
(http://www.schrodinger.com/Products/jaguar.html) - Maestro
Diponible uniquement sous Linux et SGI. Interface graphique pour Jaguar.
(http://www.schrodinger.com/Products/maestro.html)
Matrix Science
- Mascot, "a powerful search engine that uses mass
spectrometry data to identify proteins from primary sequence databases".
Serveur interrogeable à travers une interface Web ou en utilisant le client Mascot Daemon.
(http://www.matrixscience.com/)